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小麦穗分化是指小麦穗的分化形成过程。一般可分为7个时期：
(1)生长锥伸长期 生长锥开始伸长，长度大于宽度，是穗分化开始期。
(2)单棱期 由生长锥基部向上分化出穗轴节片，每节片上生出1个环状突起的苞原基。
(3)二棱期 在幼穗中部相邻两苞原基间长出小穗突起，逐渐向上部和下部发展，使幼穗呈现二棱状。
(4)小花分化期 当幼穗上中部小穗原基的基部形成颖片不久，出现小花生长点。分化顺序是在整个小穗上由中部向上、向下发展，在一个小穗上由下而上进行。
(5)雌雄蕊分化期 小穗分化出约4朵小花时，其基部小花原基的生长点分化出3个雄蕊突起，雌蕊相继分化。
(6)药隔形成期 雄蕊原基长大分化出花药的药隔，分成4个花粉囊。
(7)四分体形成期 花药进一步分化发育形成花粉母细胞、二分体，再形成四分体。小麦穂分化所需的时间与生态环境、品种、春化特性和播种季节(秋冬播和春播)有关，短者30天左右，长着可达100天以上。